Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms