Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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HDXQ7Z353 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HDXQ7Z353 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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