Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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SP6Q3SY56 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SP6Q3SY56 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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