Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK5Q16478 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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