Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSMD5Q16401 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMD5Q16401 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms