Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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