Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TLR1Q15399 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TLR1Q15399 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms