Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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