Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
CENPEQ02224 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms