Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GRIA2P42262 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GRIA2P42262 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms