Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
TSPOP30536 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
TSPOP30536 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms