Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATP5DP30049 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms