Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRAFP15056 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRAFP15056 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRAFP15056 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms