Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNNT1P13805 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms