Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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PCNAP12004 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCNAP12004 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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