Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SRP72O76094 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SRP72O76094 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRP72O76094 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms