Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.05■□□□□ 0
KLHL33A6NCF5 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL33A6NCF5 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms