Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CIZ1Q9ULV3 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms