Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CTNNA3Q9UI47 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTNNA3Q9UI47 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms