Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
XCL2Q9UBD3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms