Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CHP1Q99653 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CHP1Q99653 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms