Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD5Q8TDI0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD5Q8TDI0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CHD5Q8TDI0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CHD5Q8TDI0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHD5Q8TDI0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CHD5Q8TDI0 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHD5Q8TDI0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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