Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6ZVL8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms