Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CBLN3Q6UW01 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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