Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC174Q6PII3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms