Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms