Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms