Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC073065.1-201ENST00000411678 2866 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TSPAN2-202ENST00000369516 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RANBP3-203ENST00000439268 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PDZK1-201ENST00000344770 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GOLGA8DP-201ENST00000314246 2786 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC243972.2-201ENST00000541653 991 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 UBR5-AS1-201ENST00000499653 2048 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 BTN3A2-202ENST00000377708 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 IKBKE-203ENST00000581977 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 ACCS-201ENST00000263776 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 STK26-201ENST00000354719 3179 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ANKRD39Q53RE8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms