Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
KRTAP21-2Q3LI59 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms