Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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