Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCOA1Q15788 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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NCOA1Q15788 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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