Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.494e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 58.8□□□□□ -14e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 QKI-210ENST00000537883 1106 ntTSL 38.12□□□□□ -1.114e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.454e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 QKI-215ENST00000544823 597 ntTSL 24.84□□□□□ -1.634e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 QKI-217ENST00000545607 846 ntTSL 54.75□□□□□ -1.654e-9■■□□□ 13.1
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PCBP2Q15366 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.055e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CGGBP1-203ENST00000462901 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.655e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 ZBED4-201ENST00000216268 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 13.1
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PCBP2Q15366 NEMP1-201ENST00000300128 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.184e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CGGBP1-204ENST00000467332 556 ntTSL 46.8□□□□□ -1.325e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CGGBP1-205ENST00000474441 717 ntTSL 23.94□□□□□ -1.785e-6■■□□□ 13.1
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PCBP2Q15366 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 412.89□□□□□ -0.351e-12■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 STARD9-204ENST00000563872 553 ntTSL 415.59■□□□□ 0.098e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 STARD9-205ENST00000564158 6049 ntTSL 1 (best)10□□□□□ -0.818e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.628e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 319.83■□□□□ 0.771e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 UBE2Z-204ENST00000506498 766 ntTSL 410.34□□□□□ -0.751e-9■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 SLC5A9-207ENST00000525901 489 ntTSL 315.81■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 SLC5A9-209ENST00000532322 968 ntTSL 1 (best)13.57□□□□□ -0.243e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 NECTIN2-203ENST00000585601 650 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 NECTIN2-205ENST00000591581 950 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 AC008537.1-201ENST00000601627 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-8■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 EGLN2-214ENST00000597746 459 ntTSL 59.58□□□□□ -0.882e-8■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 43.23□□□□□ -1.891e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 PHACTR4-203ENST00000463428 1421 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.263e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.276e-8■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CADM1-205ENST00000536781 575 ntTSL 418.74■□□□□ 0.591e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 ARID3A-204ENST00000585895 377 ntTSL 225.04■■□□□ 1.67e-7■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CRLF1-205ENST00000597131 520 ntTSL 221.42■■□□□ 1.024e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.121e-17■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.046e-7■■□□□ 13.1
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PCBP2Q15366 SPTBN1-203ENST00000389980 2164 ntTSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.51e-6■■□□□ 13.1
PCBP2Q15366 MTSS1-218ENST00000529463 569 ntTSL 48.47□□□□□ -1.052e-7■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MTSS1-212ENST00000522162 553 ntTSL 46.12□□□□□ -1.432e-7■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.663e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 AKT2-222ENST00000489375 734 ntTSL 510.14□□□□□ -0.792e-15■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ASAP1-211ENST00000521075 5406 ntTSL 1 (best)5.57□□□□□ -1.524e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ELK3-201ENST00000228741 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.099e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ELK3-205ENST00000549985 684 ntTSL 37.42□□□□□ -1.229e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.349e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.215e-18■■□□□ 13
PCBP2Q15366 TTYH3-203ENST00000403167 4263 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.549e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 513.06□□□□□ -0.326e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.386e-8■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ILVBL-208ENST00000533747 788 ntTSL 217.55■□□□□ 0.41e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-212ENST00000566617 572 ntTSL 426.94■■□□□ 1.92e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.685e-12■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.542e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MINDY2-205ENST00000560289 1859 ntTSL 1 (best)24.28■■□□□ 1.482e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 TCF7L2-208ENST00000369389 691 ntTSL 422.96■■□□□ 1.272e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 FBXO41-203ENST00000520186 817 ntTSL 322.03■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZNF384-205ENST00000417772 1286 ntTSL 520.22■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZNF384-214ENST00000542605 571 ntTSL 420.09■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.772e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-205ENST00000563774 566 ntTSL 419.4■□□□□ 0.72e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 219.14■□□□□ 0.655e-12■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 418.92■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-218ENST00000567606 2042 ntTSL 1 (best)18.65■□□□□ 0.582e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MT1F-202ENST00000564295 1573 nt17.74■□□□□ 0.432e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 417.56■□□□□ 0.42e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MINDY2-201ENST00000316848 4866 ntTSL 1 (best)17.46■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZFP36-202ENST00000594442 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.3■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 OTX1-203ENST00000405984 1694 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZNF384-208ENST00000537248 594 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-215ENST00000568339 2271 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZNF384-206ENST00000436774 1096 ntTSL 316.21■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 216■□□□□ 0.155e-12■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.035e-12■■□□□ 13
PCBP2Q15366 FAM217B-204ENST00000469084 880 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 CHCHD3-204ENST00000457942 559 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.082e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 13
PCBP2Q15366 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 13
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