Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAM2Q15035 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAM2Q15035 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAM2Q15035 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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