Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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