Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RAB40BQ12829 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms