Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMARCA2P51531 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms