Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms