Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FDFT1P37268 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FDFT1P37268 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms