Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GTF2H1P32780 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1911.9 ms