Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CASQ1P31415 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CASQ1P31415 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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