Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ITGB3P05106 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms