Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZBED1O96006 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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ZBED1O96006 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZBED1O96006 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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