Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MTSS1O43312 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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