Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRPO00591 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRPO00591 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms