Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CLDN25C9JDP6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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