Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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HDGFL3Q9Y3E1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HDGFL3Q9Y3E1 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HDGFL3Q9Y3E1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HDGFL3Q9Y3E1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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