Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM30AQ9NV96 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms