Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRPF18Q99633 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PRPF18Q99633 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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PRPF18Q99633 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRPF18Q99633 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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