Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PKP4Q99569 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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PKP4Q99569 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PKP4Q99569 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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