Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PHF3Q92576 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms